Sinopsis
Varios años después de The Fruit of Grisaia, el lugar que una vez fue la Academia Mihama —un refugio para jovencitas— se ha reconvertido en una instalación de entrenamiento para SORD, una organización especial centrada en la investigación y el desarrollo para la defensa nacional. Rena y Maki son especialistas en armas de fuego, Tohka y Gumi destacan como francotiradoras, Chris maneja explosivos y procesamiento de datos, y Murasaki se desempeña como hábil ninja en labores de inteligencia. Estas chicas abordan misiones demasiado complejas para la policía o las Fuerzas de Autodefensa, enfrentándose repetidamente a operaciones peligrosas. Esta es la historia de estas jóvenes, pintada en sangre y pólvora.