Geister fühlen sich schon immer zu Keitarou Gentouga hingezogen, weil er eine starke spirituelle Aura besitzt. Ein traumatisches Ereignis hat seine rechte Hand verflucht, sodass er sie stets mit einem Handschuh bedecken muss. Als College-Student im ersten Jahr möchte Keitarou ein ganz normales Leben führen. Mit der Unterstützung seiner Jugendfreundin Eiko Houzuki nimmt er einen Job als Privatlehrer an. Da er zu den Besten seines Jahrgangs gehört, ist sein erster Schüler der außergewöhnlichste Zögling der Nachhilfeagentur: Yayoi Houzuki.
Zu Keitarous Erstaunen ist Yayoi eine Verwandte von Eiko, und sie hat zwei Pupillen in jedem Auge – was es ihr ermöglicht, die Geisterwelt wahrzunehmen und gezielt bösartige Geister zu jagen, um sie zu vertreiben. Seitdem beide Eltern bei einem Autounfall ums Leben kamen, sucht Yayoi nach der mächtigen Entität, die die entschwindende Seele ihrer Mutter gestohlen hat. Als sie bemerkt, wie stark Geister von Keitarou angezogen werden, überzeugt sie ihn, ihr bei der Sammlung anderer böser Geister zu helfen, die ihr in einer zukünftigen Konfrontation nützlich sein werden. Obwohl ihre Mission gefährlich ist, willigt Keitarou widerwillig ein, sich ihr anzuschließen – selbst wenn jeder neue Geist, dem sie begegnen, sein Engagement mehr und mehr in Frage stellt.
