Pokémon sind einzigartige Wesen mit einer Fülle von Fähigkeiten und Gestalten; zahlreiche Menschen, genannt Pokémon-Trainer, fangen und trainieren sie, häufig um Kämpfe gegen andere zu austragen. Der junge Satoshi träumt nicht nur davon, ein Pokémon-Trainer zu werden, sondern auch vom Status eines „Pokémon-Meisters", und an seinem 10. Geburtstag erhält er endlich die Möglichkeit, diesen Traum wahr werden zu lassen. Zu seinem Pech sind alle drei für neue Trainer vorgesehenen Pokémon bereits vergeben, sodass nur noch Pikachu übrig bleibt, ein rebellisches Pokémon vom Typ Elektro. Doch diese zufällige Begegnung sollte der Anfang einer lebenslangen Freundschaft und eines epischen Abenteuers werden!
Aufbruch zu einer Reise, um der Allerbeste zu werden, reisen Satoshi und Pikachu zusammen mit ihren Freunden Kasumi und Takeshi – die Wasser- bzw. Gestein-Pokémon trainieren – durch wunderschöne, weitläufige Regionen. Doch Gefahr lauert an jeder Ecke. Das berüchtigte Team Rocket ist stets in der Nähe und versucht, mit hinterhältigen Plänen mächtige Pokémon zu stehlen. Es liegt an Satoshi und seinen Freunden, diese Versuche zu vereiteln, während er gleichzeitig danach strebt, die acht Pokémon-Arena-Orden zu verdienen, die benötigt werden, um die Pokémon-Liga herauszufordern und schließlich den Titel des Pokémon-Meisters zu erlangen.