Handlung
Ein Jahr vor der Ankunft der Zentraedi auf der Erde zeigt Macross Zero die Schlussphase des Konflikts zwischen der U.N. Spacy und den Anti-UN-Streitkräften. Nachdem Shin Kudo von dem modernsten Kampfflugzeug der Anti-UN abgeschossen wurde, landet er auf der abgelegenen Insel Mayan, die nahezu keine Technologie besitzt. Während Shin sich dort von seinen Verletzungen erholt, wird der Frieden der Insel durch einen Zusammenstoß mit dem neuesten Flugzeug der UN – der VF-0 – gebrochen.