Sinopse
Após o fim do Vanguard High School Koshien, Kouji Ibuki começa a ter novos pesadelos. Nome Tatsunagi faz Suiko convocá-lo para uma mansão, onde se descobre que ele consegue ver uma Torre Negra chamada Sanctuary. Essa estrutura está distorcendo a história através das linhas do tempo, e a única maneira de consertá-la é Kouji retificar um erro que ele está destinado a cometer no futuro. Consequentemente, Kouji e Suiko devem viajar pelo mundo paralelo -if- enquanto observam as Garotas Mágicas Emi Sendou e Shuka invocando unidades de Vanguard para ajudar a restaurar a história. Infelizmente, a ajuda delas é limitada, já que participar de Cardfight contra monstros de verdade se mostra em grande parte ineficaz.