過去三年間、帝光中学校は「キセキの世代」と呼ばれる伝説の五人の選手たちによって全国バスケットボールリーグを支配してきた。これらの五人の非凡な選手たちは、謎の「幻の第六人」に助けられ、その貢献が彼らの比類なき成功の鍵であった。しかし、彼らの能力が進化するにつれて、彼らのスポーツへの当初の情熱は薄れ、高校入学時に各メンバーは別々の道を歩むことになった。
誠凛高校では、バスケットボール部が新たな才能を求めて、二人の一年生、火神大我と黒子テツヤを勧誘する。当初、二人の技能は全く異なるように見える。最近アメリカから帰国した火神は、天性の才能とバスケットボールへの熱い献身を誇る。一方、黒子はほとんど目立たず、特筆すべき運動能力に欠けているが、実際には元キセキの世代の幻の第六人であることが明らかになる。
自身の力を示すことに駆り立てられて、黒子は誠凛に自分の価値を証明することに専念する。黒子の決意に動かされ、火神は彼とのパートナーシップを結び、黒子は火神の「光」を支える「影」として仕えることを約束する。誠凛のチームメイトと共に、彼らは来たるインターハイ大会で優勝を目指すが、すぐに黒子の元チームメイトからの挑戦に直面する。