Tras aceptar la invitación de un compañero para probar Darwin's Game, una misteriosa aplicación móvil, la curiosidad de Kaname Sudou, un estudiante de secundaria, lo lleva a instalarla. En el instante en que ejecuta el programa, una serpiente digital verde salta de la pantalla y le muerde el cuello, dejándolo inconsciente. Despierta en la enfermería escolar sin heridas aparentes y, tras ser enviado a descansar, racionaliza el suceso como una alucinación antes de regresar a casa. No obstante, incapaz de olvidar la intriga, Kaname vuelve a abrir la aplicación. Lo que parece un juego de lucha convencional toma un giro aterrador cuando su oponente virtual materializa en el mundo real y lo ataca con una hoja. Mientras huye para salvar su vida, Kaname comprende que Darwin's Game no es un pasatiempo inocuo, sino una batalla mortal de verdad.