Há dezessete anos, soldados imortais chamados guerreiros divinos apareceram nos campos de batalha africanos. Essas entidades, mais tarde chamadas de Ajin ou semi-humanos, foram aclamadas como uma das descobertas mais significativas da humanidade. Oficialmente, o governo declarou que eram compatíveis com humanos, mas rumores persistem de que recompensas são oferecidas pelos Ajin capturados para que sejam submetidos a experimentos secretos e desumanos.
Kei Nagai, um estudante do ensino médio indiferente que estuda para se tornar médico, só quer uma vida normal. Esse desejo simples se despedaça quando ele se envolve em um acidente de trânsito fatal. Reanimado no local, é instantaneamente rotulado como Ajin por testemunhas ávidas pela recompensa. Incapaz de compreender sua própria imortalidade ou provar sua inocência, Kei foge, lutando para sobreviver. Ele mal escapa da captura do governo quando um grupo de Ajin anarquistas entra em contato, instando-o a se juntar a suas forças e revidar contra o governo. Conforme o conflito entre humanos e Ajin se intensifica, Kei precisa decidir quem é seu verdadeiro inimigo e de que lado ficará.