A Ishiyama High é infame como uma escola de delinquentes — ninguém em sã consciência provoca um aluno da Ishi-high. Entre eles, o calouro Tatsumi Oga se destaca, ganhando o apelido de "Rei Demônio" de todos que ele já derrotou.
Certo dia, após acabar com uma gangue que o atacou, Oga encontra um bebê. Agindo por um raro impulso de bondade, ele tenta cuidar do bebê, mas a criança se apega profundamente a ele. Em pânico, Oga leva o bebê para a casa de seu melhor amigo, Takayuki Furuichi. Lá, eles são confrontados por Hildegard, uma empregada demônio que revela que o bebê é na verdade Kaiser de Emperana Beelzebub IV. Ela explica que o bebê foi enviado à Terra por capricho de seu pai, Beelzebub III, o Grande Senhor Demônio do Mundo Demoníaco, com a missão de destruir a humanidade. Quando Oga não consegue se livrar do Bebê Beel, Hildegard informa que ele deve criar a criança — porque se afastar mais de 15 metros causará a morte instantânea de Oga.
Apesar de seu passado delinquente e aparência hostil, Oga precisa assumir o fardo de cuidar de um bebê demônio. Beelzebub acompanha sua história enquanto ele lida com encontros com demônios e colegas perigosos, tudo enquanto serve como um modelo e cuidador nada convencional para o pequeno Bebê Beel.