Una luz misteriosa envuelve la Tierra, convirtiendo a toda la humanidad en estatuas de piedra. Milenios después, el mundo está cubierto de vegetación, con bosques que ocultan las ruinas de lo que fueron grandes ciudades. Una de las primeras personas en liberarse de su prisión de piedra es Taiju Ooki, quien descubre que su amigo Senkuu, un joven científico prodigiosamente dotado, ha estado planeando su despertar. Mientras Taiju anhela rescatar a la chica que ama, Senkuu está decidido a descubrir la causa del extraño suceso y reconstruir la civilización hasta su estado anterior.
Sin embargo, cuando liberan al notoriamente formidable Tsukasa Shishiou para obtener una ventaja contra los peligros de este nuevo mundo, pronto se dan cuenta de que su nuevo aliado tiene su propia agenda. Tsukasa ve su situación como una oportunidad para un nuevo comienzo, libre de la decadencia y la ruina traídas por la tecnología, y no se detendrá ante nada para realizar su visión. Incapaces de reconciliar sus puntos de vista opuestos, la fe inquebrantable de Senkuu en la ciencia choca con la fuerza instintiva y bruta de Tsukasa en lo que se convierte en un enfrentamiento épico.