希少鉱物オライカルコを介して人間の意識をロボットボディであるI-Machineへ転送できる世界において、機械の形に永久に閉じ込められる深刻なリスクが存在する。悪名高いGrayman率いるExcavate Companyは、利益のためにオライカルコを採掘する大胆なI-Machine採掘隊である。オライカルコ秘密の窃盗で誤って告発され、チームメイトに見捨てられたMaya Mikuriが救出された後、無実を証明するためにExcavate Companyに参加する。彼女の到着は、特に記憶喪失に苦しむ熟練メンバーのIdoにとって、忘れ去られた過去を解明する機会がようやく訪れるかもしれない、グループに人生を変える旅を開始させる。
