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遥かな未来、地球の環境は高まった太陽放射によって荒廃し、人間の出生率は劇的に減少した。支配体制は、「理想の子供（IC）」と呼ばれるクローン兵士たちによって秩序を維持している。砂漠を旅する商人のSam Coyneは、ICのユニットであるTheseusに追われている謎の女性Mayaと出会う。Samは彼女を自らの商船に匿うが、追跡部隊がすぐに彼らの居場所を突き止め、SamとMayaの命が危険にさらされることになる。