仮想現実ゲーム『ザ・ニューゲート』において、無数のプレイヤーがそのデジタル世界に閉じ込められていた。彼らをすべて解放しようと決意したトッププレイヤーの Shinya Kiritani は、ゲームをクリアすることを誓った。単独で最終ボスを倒した後、Shinya は彼が直前に脱出した世界と驚くほど似通った異世界へと予期せぬ転送を遂げる。
勝利を収めた後も、Shinya のゲームインターフェースとスキルは有効なまま残っており、単にログアウトすることはできないことが示された。この新たな次元から脱出する方法を模索する中、Shinya は Tiera Lucent と出会う。彼女はホテルの受付嬢であり、Shinya のゲーム時代の旧友である Schnee Raizar の弟子である。この出会いが希望の光となり、Shinya に Schnee との絆を再燃させ、ザ・ニューゲートに隠された秘密を解き明かすよう促す。
