何気ない一日、空が突然裂け、未知の存在である「アンノウン」が放出され、人類を容赦なく襲撃した。未来を守るため、日本のすべての子供たちは戦争が終結するまで冷凍保存された。
数年後、人類が日本国内の戦場となった一角に足掛かりを得た頃、子供たちは目覚めさせられた。冷凍状態にあった間、それぞれが「ワールド」と呼ばれる独自の超能力を獲得していた。最も強力な六名は、奪還された都市を指揮し、その能力を用いて終わりのない侵攻から防衛する任務を負った。その中には、東京を治める幼馴染のイチヤ・スザクとカナリア・ウタラ、千葉を管理する兄妹のカスミとアスハ・チグサ、そして神奈川を統括するマイヒメ・テンカワとホタル・リンドウが含まれていた。
アンノウンからの日常的な攻撃が続く中、都市の指導者たちと副官との間の個人的な対立が深まり、些細なライバル心が芽生え、三都市間で頻繁な争いが勃発した。しかし、アンノウンが突如として攻撃を激化させたことで、東京、千葉、神奈川の指導者たちは、人類の絶滅を防ぐ最後の砦を失うか、あるいは団結するかの瀬戸際に立たされる。
