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上映時間と制作規模から判断すると、これはビデオシリーズの第4作であるようだ。ホームビデオ版の販促を目的として劇場で上映された。

Mary Bell, Yuri, Ken, Ribbon, and Tambourine go to Flower Land to see Toto (the Phoenix) on his birthday.

コンディション・グリーン、通称第801小隊は、キース、ジョージ、エドワード、ヤン、ショウの5名で構成されている。この小隊は、インフェリオス銀河の故郷の惑星を異星からの脅威から守る任務を負っている。ガザリアの邪悪な皇帝ヴィンスが近隣の惑星カルとグラナドを征服し始めた時、コンディション・グリーンは彼らの世界への攻撃に対する最後の砦として機能した。

西暦2089年、最初の宇宙戦争から80年後、人類とゼントラーディの関係は大きく変わり、両種族は地球で平和に共存していた。しかし、太陽系内に異星の種族マルドゥクが現れるという新たな脅威が芽生える。SNNで働く新人記者のヒビキ・カンザキは、UNスペーススパシーとマルドゥク軍の最初の衝突を取材することになる。その遭遇の中で、ヒビキはマルドゥクの戦闘能力を増幅させる歌を歌う「エミュレーター」のイシュタルと出会う。ヒビキはイシュタルを地球に連れて行き、人間の生活や文化を体験させようとする。一方、熟練のバルキリーパイロット、シルヴィ・ゲナと共に、ヒビキとイシュタルはマルドゥクのリーダーであるイングスを倒し、地球の破壊を防ぐ方法を見つけるために協力しなければならない。