Heath Oslo事件の直後、米日合同対テロユニットCIRSが一般に知られるようになり、大規模な再編成が行われた。この一環として、国家防衛のための次世代要員を育成する組織SORD(Social Ops, Research & Development)が設立された。
SORDは国内に複数の専門訓練校を運営しており、その一つとしてかつて廃校だった美浜学園が再活用されている。美浜では、個性的な能力を持つ若き女性たちが、実弾を用いた過酷な訓練や現地の任務を通じて、集中的な教育を受けている。
危険が伴うものの、これらの生徒たちは度々、国家の安全保障維持のために秘密作戦に投入される。彼らの人生は、多大な個人的犠牲を払ってでも領域を防衛することに捧げられている。
「我々の存在は認められた。だが、単なる承認では不十分だ。目的を持たなければ何の意味もない。他人に使われるだけでは十分ではない。自らの力で生き残るために戦わねばならない。そうして初めて、贖罪への道が開けるかもしれない……」
これらの課題に直面し、武装戦闘の道を選んだ少女たちの前に何が待ち受けているのか。