1か月の病気療養を経て、夜見山北中学校3年3組への転校が遅れた後、榊原 光一は病院で回復し、眼帯をした静かな少女・美咲 芽衣と出会う。光一は彼女との奇妙な絆を感じ取るが、新しいクラスメイトたちは美咲を存在しないかのように扱い、彼に無関係なことに近づかないよう警告する。その助言を無視し、光一は美咲と親しくなり、仲間たちの不安の恐ろしい源を解き明かそうとする。
囁かれる噂は、かつての3年3組の生徒に焦点を当てるが、誰も光一に悲劇の出来事の全容を明かさない。クラスを悩ます不気味な呪いを調査する中で、光一はそれが美咲とどう結びついているのか理解しようと試みる。恐ろしい事件が次々と起こり始める中、光一、美咲、そして他の生徒たちは凍りつくような謎を解かなければならないが、真実は恐ろしい代償を要求する。