『カルネバル』の物語において、純粋な心を持つ青年ナイは、古びた腕輪と「カロック」という手掛かりだけを頼りに、自分にとって非常に重要な人物を探して旅に出る。その旅は、彼を囚人として監禁しようとする怪物のような女性に捕らえられたことで方向を変える。その女性に侵入して略奪を試みていた賢く器用な泥棒ガレキによってナイは救出される。その結果、二人は追われる身となり、国のトップ防衛組織「サーカス」の活動に巻き込まれていく。
サーカスは、肉を貪る不気味な生物「ヴァルガ」から一般市民を守り、謎めいたカフカ組織の活動を探る任務を負っている。サーカスがナイの腕輪が実は古代のサーカスの身分証であることを知ると、彼に関心を抱く。ナイはサーカスの保護下に残ることを望むが、ガレキは船内での生活になかなか馴染めないでいる。カロックを探し続ける中で、ナイとガレキは、ナイに惹きつけられるように見えるヴァルガからの脅威に直面していく。