幕末の黄昏時、凶悪な暗殺者・人斬り抜刀斎が、比類なき殺戮の腕前をもって国中に恐怖を走らせ、日本の革命のさなかに見失われた。それから10年の平和が訪れたが、抜刀斎の名を口にするだけで、元兵士たちは今もなお戦慄する。
彼らには知られていないが、抜刀斎は暴力の道を捨て、贖罪を求めて生きることを決意し、現在は陽気で元気な浪人・緋村剣心として生きている。二度と命を奪わないと誓った剣心は、弱者を守ることに身を捧げる。ある運命の日に、彼は剣道場を営む神谷薫と出会う。その道場は、抜刀斎を名乗る偽物によって脅かされていた。剣心が彼女を助けた後、薫は彼に道場で暮らすよう誘い、元殺し屋はしばらくその道場で滞在することになる。
『るろうに剣心 -明治剣客浪漫譚-』は、剣心が必要な人々を助ける旅を描く。しかし、過去と現在の敵たちが次々と現れる中、改心した戦士は新たな信念を貫くことができるのか?