闇と悪が夜を這い回り、道行く者を無差別に襲う時、ヘルシングは人類最後の防衛線としてこれらの怪物たちに立ち向かう。インテグラ・フェアブルック・ウィンゲーツ・ヘルシングの指揮の下、組織は強力な軍事力を用いて市民を不死者から守る。しかし、インテグラの最大の戦力は、自らの同族を狩る吸血鬼アーカードである。新たに眷属となったセラス・ヴィクトリアと共に、アーカードは超自然的な敵や、ヘルシングの権威に挑む者たちと、その道徳的立場を問わず対峙する。人類の生存が危機に瀕する中、『ヘルシング アルティメット』は、真の力が最も予期せぬ起源から生まれ得ること、そして最も恐るべき存在が人類最大の守護者となり得ることを示す。