R シーズンと同様、SailorStars は 2 つのアーチに分割されている。
最初のアーチでは、SuperS シーズンからの未解決の課題がいくつか解決され、アウター・センシのハルカ、ミチル、セツナ、そして子供として生まれ変わったホタルが帰還する。
2 つ目のアーチは、原作漫画の主要なプロットに従う。ウサギはマモルがアメリカへ留学するために旅立つ別れを告げる。その間、3 人の少年、セイヤ、タイキ、ヤテンからなるアイドルトリオであるスリー・ライツが現れる。新たな敵は、人間のスターシードを集めて銀河全体を支配しようとする女性、ギャラクシアである。3 人の新たなセンシ、セーラー・スターライトが現れ、セーラームーンの助けを借りずにギャラクシアを倒すことを目指す。