人が窮地に陥ると、謎の赤い電話番号が現れることがある。それは自分を夜ト神と称する貧乏神・夜トへとつながる番号だ。彼は何百万人もの信者を集めることを夢見るが、一つの神社も持たないためにその野望は叶わず、安い五円の仕事で食いつなぐしかない。さらに、彼の武器である神器のパートナーが彼の無能さに幻滅して去ってしまい、状況はさらに悪化する。しかし、運命のいたずらか、中学生の壱岐ひよりが夜トを交通事故から救おうとして命を落としかける。彼女は一命を取り留めたものの、その霊は不安定になり、魂が体から離れてしまうようになる。元の状態に戻りたいと願うひよりは、夜トに自分の状態を治すよう強く求める。そのためには新しい神器のパートナーを見つける必要がある。しぶしぶながら、ひよりはその探索に協力することを承諾し、夜トの運命がようやく好転するかもしれないというかすかな希望の光が差し込む。