あらすじ
レギルド世紀1014年、ユニバース世紀の激しいモビルスーツの戦いから千年が経過した。アムロ・レイやシャ・アズナブルといった伝説のパイロットが戦場を支配していた時代である。地球表面は大半が無人となり、人類は主に宇宙コロニーや月で暮らしている。 首都警備隊養成校の生徒であるベルリ・ゼナムは、穏やかな学校生活を送っていたが、海賊パイロットのアイダ・スルガンとそのモビルスーツ、G-セルフの捕獲によって、その日常は崩れ去る。ベルリはG-セルフと強い精神リンクを結び、それを操縦できることを発見する。その後、「首都警備隊」と呼ばれる、地球連邦軍に反対し秘密の任務を遂行する反乱集団に関与することになり、ベルリはアメリアン戦艦メガファウナでアイダと共闘する。二人はG-セルフを用いて、首都警備隊とその強力な指導者であるクンパ・ルシタ大佐と謎めいたマスク大尉に立ち向かわなければならない。
