あらすじ
西暦2066年、国連の重要な加盟国であるホントワール共和国が、理由も告げずに突如として脱退し、世界中に不安定さをもたらして地球の安全保障を脅かす。間もなく、トライアッド共和国の首都ミョーリが、鳥の姿をした強固な飛行要塞タートルキングによって攻撃される。 国際科学機構（ISO）の所長であるコウザブーロウ・ナンブ博士は、この謎めいた脅威に対峙する任務を負う。一方、数人のトップISO研究者が行方不明となっている。これらの謎を解明するため、科学忍者隊、すなわちガッチャマン戦士が再結成される。 チームがベルク・カッツェと悪名高いギャラクター組織と戦ってから数年が経過した。今、イーグルとも呼ばれるケンが、再びこの強力な敵に対してチームを勝利へと導くことができるのか？
