En un pueblo próspero, tirar objetos es una costumbre habitual entre sus habitantes. No obstante, para Rudo, quien reside en los barrios bajos, esos desechos poseen un gran valor. A pesar de las advertencias constantes de su padre adoptivo, Regto, Rudo busca incansablemente artículos reutilizables destinados al enorme vertedero conocido como el Pit. Debido a su inmensa escala, el Pit también funciona como método de castigo penal: quienes son arrojados allí jamás regresan.
Tras el asesinato de Regto por parte de un desconocido, Rudo es injustamente culpado del crimen y lanzado al Pit. Allí despierta rodeado de montañas de basura y confrontando monstruos gigantes nacidos de los desechos. Mientras el aire tóxico y las Trash Beasts lo empujan hacia la muerte, Rudo es rescatado por Enjin, miembro de los Cleaners, quienes emplean armas llamadas Vital Instruments para luchar contra tales criaturas. Al obtener su propio Vital Instrument, Rudo decide unirse a los Cleaners con la esperanza de hallar una salida del Pit y vengar a su padre.