Adaptado del manga shounen de Akamatsu Ken serializado en Shounen Magazine, esta historia gira en torno a Negi Springfield, un mago de diez años de Gales que anhela seguir los pasos de su padre ausente como Magister Magi, un tipo único de mago que ayuda a la gente común, a menudo disfrazando su trabajo como ayuda humanitaria a través de ONG. Inicialmente asignado como profesor de inglés en la Academia Mahora en Japón, Negi es destinado a una clase de secundaria compuesta por 31 chicas, todas mayores que él. Sin embargo, los tranquilos días escolares pronto se ven interrumpidos cuando aparecen personas vinculadas al pasado de su padre, y Negi se ve obligado a forjar contratos mágicos con varias de sus estudiantes para hacer frente a las amenazas emergentes. Con el tiempo, parte con sus compañeros hacia el Mundo Mágico en busca de su padre perdido hace mucho tiempo. Esta película marca el final del viaje retratado en los OVAs Shiroki Tsubasa Ala Alba y Mou Hitotso no Sekai.
