Hace medio siglo, unos seres aterradores conocidos como los «enemigos de la humanidad» aparecieron por todo el mundo. En respuesta, jóvenes con habilidades sobrenaturales llamadas «Talentos» —como la piroquinesis y el viaje en el tiempo— se entrenan en una academia en una isla remota para combatirlos. Nanao Nakajima se distingue de sus compañeros porque no posee ningún Talento. Aunque a menudo es acosado por sus compañeros dotados, continúa entrenando. La situación cambia cuando llegan dos nuevos estudiantes: Kyouya Onodera, que despierta misterio, y Nana Hiiragi, que puede leer mentes. A medida que el grupo comienza a unirse como nakama, ocurren extrañas desapariciones que amenazan la estabilidad de su clase.
