Después de ser atropellado por un camión en 2014, Akira Natsume despierta y se encuentra dentro de una máquina tras un coma de 16 años. Mientras se adapta al nuevo sistema, la oficial de policía Minami Uezono y su compañera androide Alma lo reciben. Le explican que su cerebro está almacenado en un dispositivo llamado EX-ARM, un arma de destrucción masiva. Atrapados en un barco contrabandista enemigo, los tres deben escapar usando solo su ingenio y habilidades de combate.
Aunque inicialmente duda en pelear, Akira recuerda las palabras de su hermano antes del accidente. Ese recuerdo lo impulsa a actuar, tomando el control del cuerpo de Alma para enfrentarse a los oponentes con artes marciales. Cuando Alma lo conecta a uno de los puertos del barco, descubre el inmenso poder del EX-ARM al hackear fácilmente la nave y tomar el control.
Tras regresar a tierra firme, Akira conoce a los demás miembros del Equipo de Prevención de Contramedidas contra EX-ARM, una unidad policial centrada en reducir el impacto de los EX-ARM. Al ver los horrores cometidos por quienes buscan el poder de los EX-ARM, decide unirse al equipo y detener el terror que causan estas armas.
