Haruka Nanase siente una pasión inmensa por el agua y una necesidad imperiosa de nadar. Durante su etapa en la escuela primaria, se unió a sus tres amigos, Rin Matsuoka, Nagisa Hazuki y Makoto Tachibana, para vencer en una carrera de relevos. Tras aquel triunfo, los cuatro tomaron caminos distintos. Años después, se reencuentran en la secundaria, aunque Rin no demuestra interés en restaurar su antiguo lazo; asiste a una escuela diferente y su único deseo es demostrar que nada mejor que Haruka. Después de un encuentro tenso, Haruka, Nagisa y Makoto fundan el Club de Natación de la Secundaria Iwatobi, pero requieren un cuarto miembro para poder participar en el próximo torneo. Nagisa logra reclutar a Rei Ryuugazaki, quien anteriormente compitió en atletismo de pista, para ocupar ese puesto. Mientras se acerca la competencia, los cuatro fortalecen su unión a través de un entrenamiento intenso, con el objetivo de ganar el evento y poner fin de una vez por todas a la rivalidad entre Haruka y Rin.
