Daikichi Kawachi es un hombre soltero de treinta años que, aunque cuenta con un empleo estable, carece de dirección en su vida. Tras el fallecimiento inesperado de su abuelo, regresa a la casa familiar para el funeral, donde conoce a Rin, una joven tranquila que resulta ser la hija ilegítima de su abuelo. Reservada y distante, Rin es considerada una deshonra por la familia; todos los parientes de su padre se niegan a acogerla después de su muerte, dejándola completamente aislada. Enfurecido por la insensibilidad mostrada hacia Rin, Daikichi declara que él se encargará de criarla, a pesar de ser un hombre soltero sin experiencia en la crianza. Usagi Drop narra el viaje de Daikichi hacia la paternidad mientras cuida de Rin con su naturaleza amable y cariñosa, explorando el afecto y la confianza mutua que forman la base de una familia amorosa y estrechamente unida.