Sinopsis
Tras el cierre de la masivamente popular MMORPG de realidad virtual The World, su secuela, The World R:2, se lanza en línea. Durante su debut, el novato jugador Haseo cree haber encontrado compañeros para sus aventuras, solo para que su avatar sea asesinado por ellos por diversión. Es rescatado por Ovan, quien tiene un solo brazo, y accede a guiarlo a través del juego. Haseo pasa un feliz primer año junto a Ovan y Shino, quien es clérigo. Sin embargo, la tranquilidad se rompe cuando el personaje de Shino es derrotado por Tri-Edge, una figura notoria cuyos ataques dejan a sus víctimas en coma en el mundo real. Enfurecido, Haseo jura cazar y destruir a Tri-Edge. Ambientado durante el primer año de Haseo en The World, .hack//Roots profundiza en los lazos que formó antes de que Tri-Edge los destruyera.