En 1864, en Japón, una joven llamada Chizuru Yukimura busca a su padre desaparecido, Koudou, un médico cuya profesión a menudo lo lleva lejos de casa. Tras meses sin noticias, Chizuru se viste de hombre y viaja a Kioto para encontrarlo. Mientras intenta evitar la atención de los ronin, se esconde y presencia una escena espeluznante: los ronin son brutalmente asesinados por unos hombres enloquecidos de pelo blanco. De repente, miembros del Shinsengumi llegan y matan a las criaturas. Pero la seguridad de Chizuru dura poco, ya que estos hombres la atan y la llevan a su cuartel general, debatiendo si dejarla vivir o matarla definitivamente.
Cuando ella revela el nombre de su padre, el Shinsengumi decide protegerla, revelando que ellos también han estado buscando a Koudou. Sin embargo, Koudou tiene vínculos más profundos con el Shinsengumi de lo que admiten, y pronto Chizuru se ve envuelta en el conflicto entre el Shinsengumi y sus enemigos, así como en la agitación política en Kioto.