Sinopsis
Un siglo después de que enormes desplazamientos tectónicos sumergieran la mayor parte de Japón, la nación ahora prospera como una sociedad marítima. Ciudades prósperas bordean las costas, y rutas marítimas bien defendidas son mantenidas por buques navales especializados. La industria marina está en auge, y las jóvenes aspiran con entusiasmo a unirse a las Sirenas Azules —marineras de élite que dedican sus vidas a salvaguardar los océanos. Reunidas tras una larga separación, las amigas de la infancia Akeno Misaki y Moeka China se inscriben en la Escuela Superior Marina de Chicas de Yokosuka, donde conocen a otras que comparten su ambición de convertirse en Sirenas Azules. Pronto comienzan los ejercicios de entrenamiento, y Akeno y Moeka son asignadas al mando de sus propios barcos y tripulaciones. Akeno se adapta sin problemas a su rol como capitana a bordo del destructor Harekaze, fomentando la camaradería entre su tripulación. Pero cuando fallos inesperados en el motor y la navegación dejan el barco varado, la tripulación se enfrenta a un grave peligro. High School Fleet sigue a la valiente tripulación del Harekaze mientras navegan por aguas peligrosas y superan obstáculos en su camino para convertirse en Sirenas Azules de pleno derecho.