Sinopsis
En el año T.C. 4767, la humanidad huyó de la Tierra hace cuatro milenios y ahora se enfrenta a una crisis existencial contra los hostiles alienígenas Gnosis. Para combatir este peligro, Shion Uzuki, del departamento de ingeniería de Vector, creó a KOS-MOS, un androide especializado de gran capacidad. Sin embargo, tras la destrucción de su nave por los Gnosis, Shion y sus aliados se ven sumergidos en un conflicto caótico sin aliados ni enemigos discernibles.