Sinopsis
Un año antes de la llegada de los Zentraedi a la Tierra, Macross Zero muestra las etapas finales del conflicto entre la U.N. Spacy y las fuerzas anti-ONU. Después de ser derribado por el caza de última generación de los anti-ONU, Shin Kudo, piloto de élite, acaba en la remota isla de Mayan, que carece de casi cualquier tecnología. Mientras Shin se recupera allí de sus heridas, la paz de la isla se ve interrumpida por un enfrentamiento en el que aparece la aeronave más reciente de la ONU: la VF-0.