Sinopsis
Presentando una narrativa independiente de la continuidad cinematográfica original de Appleseed a pesar de compartir el mismo director, Appleseed Alpha ofrece un origen alternativo para sus protagonistas. A diferencia de iteraciones anteriores, Briareos ya es una persona cyborg y no comparte separación ni reencuentro previo con Deunan antes de unirse a ESWAT en Olympus. La historia se centra en los primeros días de Deunan Knute y Briareos en el siglo XXII mientras atraviesan las ruinas distópicas de Nueva York, en busca de la ciudad utópica de Olympus. Contratados por Two Horns, quien gobierna la ciudad devastada, al dúo se le encomienda destruir máquinas de combate bípedas. Durante esta misión, se cruzan con Iris y Olson, quienes están en su propia misión. Después de trabar amistad con ellos, Deunan y Briareos deciden aliarse con la pareja. El objetivo de Iris es impedir que Talos, una persona cyborg siniestra, se apodere de un arma humana secreta. Sin embargo, Talos manipula a Iris para que active la colosal máquina de guerra.