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Koyomi Araragi, un estudiante de tercer año de secundaria, sobrevive a un ataque de vampiro gracias a Meme Oshino, un hombre peculiar que vive en un edificio abandonado. Aunque es devuelto a su humanidad, persisten efectos secundarios como curación sobrehumana y visión mejorada. Con el apoyo de Tsubasa Hanekawa —su camarada y presidente de clase—, Araragi intenta llevar una vida estudiantil normal. Cuando atrapa a su compañera de clase Hitagi Senjougahara mientras cae por unas escaleras, Araragi se da cuenta de que ella es anormalmente ingrávida. A pesar de la renuencia de Senjougahara, Araragi insiste en ayudarla y recurre a Oshino —el mismo hombre que una vez resolvió su propia crisis—. A través de una serie de historias que involucran demonios y dioses, Bakemonogatari sigue a Araragi mientras trabaja para ayudar a quienes sufren aflicciones sobrenaturales.

En el distrito céntrico de Ikebukuro, en Tokio, circulan extraños rumores sobre pandillas anónimas y personas peligrosas, pero la leyenda urbana más famosa es la "Black Rider" sin cabeza: una figura que se ve montando una motocicleta negra como el azabache por las calles de la ciudad. Mikado Ryuugamine siempre ha anhelado la emoción de la vida urbana, y una invitación de alguien que conoce desde la infancia lo convence de mudarse a Tokio. En su primer día, atisba a la Black Rider, y parece que su deseo de aventura se ha cumplido. Sin embargo, a medida que se desarrollan eventos sobrenaturales, personas comunes como él, junto con los residentes más excéntricos de Ikebukuro, se ven envueltos en el caos que estalla por toda la ciudad.

El joven Ciel Phantomhive ostenta el título de «Perro Guardián de la Reina», encargándose de los diversos incidentes inquietantes que surgen en la Inglaterra victoriana en nombre de Su Majestad. Con la ayuda de Sebastian Michaelis, su fiel mayordomo que posee habilidades aparentemente sobrehumanas, Ciel emplea cualquier método necesario para cumplir con sus tareas. Sin embargo, puede haber más oculto tras este mayordomo de negro de lo que parece inicialmente. El pasado de Ciel oculta un trágico secreto que lo sumergió en una oscuridad perpetua; en uno de sus momentos más desesperados, forjó un contrato con Sebastian, un demonio, intercambiando su alma por la venganza contra quienes lo dañaron. Hoy en día, Sebastian no solo es un mayordomo de los infiernos, sino también el sirviente ideal para ejecutar las órdenes de su amo, todo mientras espera con ansias el delicioso banquete que finalmente hará del alma de Ciel. Mientras la pareja trabaja para resolver el misterio detrás de la serie de desgracias de Ciel, se desarrolla entre ellos una conexión que ni el cielo ni el infierno pueden romper.

Ambientada en Chicago durante principios de la década de 1930, el legendario tren transcontinental Flying Pussyfoot emprende un viaje que dejará un rastro de sangre a través de la nación. Simultáneamente, en Nueva York, el ambicioso científico Szilard y su asistente Ennis, quien actúa de mala gana, buscan botellas perdidas del elixir de la inmortalidad mientras los conflictos de la mafia se intensifican. En 1711, a bordo del Advena Avis, unos alquimistas están a punto de descubrir el verdadero costo de la inmortalidad. Basado en las galardonadas novelas ligeras, Baccano! entrelaza eventos aparentemente no relacionados en tiempo y lugar en una narrativa más amplia que involucra alquimia, supervivencia y vida eterna. Los bondadosos aspirantes a ladrones Isaac y Miria actúan como un nexo, conectando a varios personajes con sus propias agendas ocultas y creando vínculos y consecuencias de por vida para todos los involucrados.

Los Mushi representan las expresiones más fundamentales de la vida, existiendo únicamente para ser, completamente libres de las limitaciones de conceptos morales como el bien y el mal. Estas entidades se manifiestan en innumerables formas, capaces de imitar elementos de la naturaleza como la flora, las enfermedades e incluso fenómenos atmosféricos como los arcoíris. Sin embargo, esta descripción apenas roza la superficie de los misteriosos seres que pueblan el mundo de Mushishi; calificarlos como vida es en sí mismo una reducción. El conocimiento exhaustivo sobre los Mushi es raro, ya que la mayoría de las personas permanecen ajenas a su presencia. Esta ignorancia alimenta las constantes indagaciones de Ginko, un Mushishi que dedica su vida a estudiar estas criaturas para comprender su papel dentro del orden natural. Sigue rumores de eventos potencialmente vinculados a los Mushi, impulsado por la esperanza de que descubrir su verdad pueda, en última instancia, revelar el mismísimo significado de la existencia.

Lain Iwakura, una estudiante de catorce años, tímida y socialmente torpe, recibe un peculiar correo electrónico de Chisa Yomoda, una compañera de clase que recientemente se ha quitado la vida. A pesar de no tener interés ni experiencia con la tecnología, Lain abre el mensaje, que la transporta a la Wired, una red de comunicación digital similar a la internet del mundo real. Su existencia se ve trastocada al enfrentarse a una serie de enigmáticos acertijos. Individuos conocidos como los Men in Black comienzan a aparecer en su vecindad, interrogándola con un conocimiento de su vida que supera su propia conciencia de sí misma. A medida que la línea entre la realidad física y el ciberespacio se vuelve cada vez más difusa, Lain se ve arrastrada a situaciones cada vez más surrealistas que desafían las nociones tradicionales de identidad, conciencia y percepción. Creado por Chiaki J. Konaka, quien creó Texhnolyze, Serial Experiments Lain es un misterio psicológico y vanguardista que sigue las decisiones cruciales de Lain, que resuenan tanto en el mundo tangible como en la Wired. Solo Lain puede comprender el verdadero peso de estas existencias duales mientras un reino se cierra y otro se abre.

Ryuu Yamada comenzó la preparatoria con la esperanza de empezar de nuevo y tener una vida más productiva. Eligió la preparatoria Suzaku para que nadie supiera de su violento pasado como delincuente. Pero el aburrimiento pronto se apoderó de él, y para su segundo año, Ryuu había vuelto a sus viejas costumbres: perezoso, malas calificaciones y peleas constantes. Un día, tras otra visita a la oficina, se topa con Urara Shiraishi, una hermosa estudiante de honor. Un momento de torpeza los hace caer por las escaleras, ¡lo que resulta en un beso accidental! Los dos descubren que pueden intercambiar cuerpos con un beso, un poder que resulta tanto conveniente como problemático. Cuando el oficial del consejo estudiantil y único miembro del Club de Estudios Sobrenaturales, Toranosuke Miyamura, se entera de su habilidad, los recluta para el club. Acompañados por Miyabi Itou, a quien fascina todo lo sobrenatural, el grupo descubre la leyenda de las Siete Brujas de la preparatoria Suzaku: siete alumnas que poseen cada una un poder único activado por un beso. El Club de Estudios Sobrenaturales emprende su primera misión: encontrar a todas las brujas.

Koyomi Araragi se ha recuperado recientemente de un ataque de vampiros y se ha encontrado con múltiples chicas afectadas por aflicciones sobrenaturales. Para colmo, una mañana se despierta y se encuentra secuestrado y atado por su novia Hitagi Senjougahara. La hermana de Araragi, Karen, se ha metido en problemas con Deishuu Kaiki, un estafador que una vez timó a la familia de Senjougahara. En consecuencia, Senjougahara ha atrapado a Araragi para protegerlo del astuto Kaiki. Sin embargo, cuando Araragi recibe un mensaje desesperado de Karen, parte para salvarla. Más allá del aprieto de Karen, Tsukihi, la otra hermana de Araragi, lidia con sus propios problemas. Y cuando dos mujeres enigmáticas entran en sus vidas, ni siquiera Araragi puede prever sus verdaderas intenciones o los devastadores secretos sobre su familia que pronto serán revelados.

Anomalías, apariciones y deidades siguen apareciendo alrededor de Koyomi Araragi y su círculo cercano de acompañantes: Tsubasa Hanekawa, la intelectual modesta del grupo; Shinobu Oshino, la vampiro aficionada a las rosquillas; Suruga Kanbaru, la alborotadora atlética; Mayoi Hachikuji, un espíritu propenso a morder; Nadeko Sengoku, la dulce admiradora de Koyomi; y Hitagi Senjougahara, la ecléctica novia de Koyomi. Ha comenzado un nuevo trimestre y, con la graduación acercándose, Koyomi debe decidir urgentemente su camino futuro, las relaciones que cultivará y a qué amigos rescatará. Sin embargo, cuando comienzan a ocurrir incidentes extraños, Koyomi está ausente, y en su ausencia aparece una feroz anomalía tigre. Hanekawa se convierte en su objetivo y pronto se da cuenta de que debe defenderse.

Tras la muerte de sus padres, Shinpei Ajiro creció con la familia Kofune y sus hijas, Mio y Ushio. Más tarde dejó su isla natal para estudiar en Tokio, pero regresa cuando Ushio muere trágicamente ahogada mientras intentaba salvar a una niña pequeña. En su funeral, su mejor amigo le cuenta sobre moretones encontrados alrededor del cuello de Ushio, lo que plantea dudas sobre la verdadera causa de su muerte. Creyendo que pudo haber ocurrido un asesinato, Shinpei comienza a reexaminar los eventos recientes, pero sucesos extraños no dejan de ocurrir. Personas desaparecen y otros eventos inexplicables llevan a Mio a recordar un viejo cuento popular sobre unas criaturas llamadas «Sombras» que podrían no ser mera ficción. Según la leyenda, encontrarse con la Sombra de alguien presagia la muerte inminente de esa persona. Enfrentándose al lado oscuro de la isla Hitogashima, Shinpei lucha contra su sombrío destino para cumplir el último deseo de Ushio: proteger a Mio.

Un frío día de diciembre, Kyon se dirige a la escuela esperando otra salida con sus compañeros de la SOS Brigade. Pero para su asombro, casi todo ha cambiado drásticamente: Haruhi Suzumiya e Itsuki Koizumi faltan; Mikuru Asahina no tiene memoria de él; Yuki Nagato es una persona normal; y Ryouko Asakura ha reaparecido inexplicablemente. Aunque no es ajeno a lo sobrenatural, Kyon está inquieto por este extraño suceso y se dispone a investigar por su cuenta. Al darse cuenta de que es la única persona que recuerda la realidad anterior, Kyon se enfrenta a una difícil decisión: aceptar la vida ordinaria que una vez anheló, o encontrar una manera de revertir el tiempo y restaurar su mundo caótico pero familiar.

En el tranquilo pueblo de Sotoba, la vida es apacible y todos se conocen. Sin embargo, todo se torna sombrío cuando Megumi Shimizu, una joven ambiciosa, muere de repente a causa de una misteriosa enfermedad. A medida que avanza el caluroso verano y se producen más muertes inexplicables, Toshio Ozaki, quien ejerce la medicina en el pueblo, empieza a sospechar que tras los decesos hay una fuerza más siniestra. Toshio une fuerzas con Natsuno Yuuki, un adolescente distante, y con los hermanos Kaori y Akira Tanaka —amigos de Megumi— para desentrañar la verdad sobre las muertes del pueblo. Su investigación conjunta los conduce hacia un inquietante secreto relacionado con la familia recién llegada que reside en la mansión Kanemasa.

Yuuki Cross y el severo Zero Kiryuu forman parte del comité disciplinario de la Academia Cross, una institución dividida en la Clase Diurna y la Clase Nocturna. Su deber consiste en mantener el orden durante la transición entre estos grupos. Sin embargo, la Clase Diurna ignora la realidad de que los estudiantes de la Clase Nocturna son en realidad vampiros. Una década antes, Yuuki fue rescatada de un ataque vampírico por Kaname Kuran, un Sangre Pura. Kaname lidera ahora la Clase Nocturna, y el rol de Yuuki le permite encontrarse con él con frecuencia, lo que profundiza sus complicados sentimientos. En contraste, Zero siente un intenso odio hacia los vampiros, convencido de que humanos y vampiros no pueden coexistir en paz. Sin embargo, un aspecto oculto del pasado de Zero pronto pone en peligro el delicado equilibrio en la academia, prometiendo cambiarlo todo para siempre.

Las misteriosas entidades inmortales conocidas como Ajin aparecieron por primera vez en África hace diecisiete años. Debido a que sus cuerpos indestructibles representan una amenaza para la humanidad y podrían ser explotados con fines maliciosos, son detenidos inmediatamente al ser descubiertos. Kei Nagai, un estudiante de secundaria trabajador con aspiraciones de convertirse en médico, ignora en gran medida el plan de estudios escolar sobre estos seres, habiéndolos visto solo ocasionalmente en las noticias. Aunque le enseñan que los Ajin no son humanos, su ignorancia resulta irrelevante cuando sobrevive a un accidente fatal que desencadena su transformación en Ajin, sumiéndolo en un intenso sufrimiento. Mientras huye solo de un mundo que lo persigue, Kei descubre que otros miembros de su especie podrían estar ocultos a plena vista.

Tras sobrevivir a un ataque vampírico, Koyomi Araragi nota que su amiga y salvadora, Tsubasa Hanekawa, se comporta de manera extraña. Cuando se topa con ella de camino a una librería y ve que tiene una venda en la cara, sabe que algo definitivamente anda mal. Araragi quiere ayudarla, pero Hanekawa insiste en que la herida es solo algo que se hizo en casa y que no debería preocuparse. Sin embargo, cuando un gato blanco sin cola es atropellado y muerto por un coche, los dos entierran a la criatura y comienzan los verdaderos problemas. Cuando Araragi visita más tarde a su amigo Meme Oshino y le cuenta lo sucedido ese día, se entera de que lo que enterraron es en realidad una aparición, una perfectamente adecuada para Hanekawa en su estado actual. Encargado de encontrar a su amiga para confirmar que está a salvo, Araragi descubre que ella ha atacado a sus padres, poseída por el "Sawari Neko". Ahora le toca a Araragi ayudar a Hanekawa, tal como ella lo ayudó a él una vez.

Durante su segundo año en la Escuela Secundaria Privada Naoetsu, Koyomi Araragi se encuentra con Tsubasa Hanekawa, la mejor estudiante de su clase. Durante su conversación, ella comparte un rumor inquietante sobre una vampira de deslumbrante cabello rubio y ojos gélidos que ronda la zona. Araragi descarta la historia mientras disfruta de la compañía de una nueva amiga. Más tarde, de camino a casa, nota manchas de sangre que llevan hacia las escaleras del metro. Intrigado, sigue el rastro hasta lo profundo de la estación. Allí descubre la fuente: la vampira rubia mencionada en el rumor, destrozada. Cuando ella pide su ayuda, Araragi se enfrenta a una elección que podría alterar su destino para siempre.

Los youkai y los espíritus que coexisten con los humanos generalmente mantienen la paz, aunque una minoría peligrosa amenaza el frágil equilibrio entre su mundo y el nuestro. Kotoko Iwanaga, quien ostenta el título de Diosa de la Sabiduría, actúa como mediadora para resolver estos conflictos sobrenaturales. Se acerca al estudiante universitario Kurou Sakuragawa, cuya reciente ruptura lo ha dejado vulnerable, sospechando que está conectado con una presencia sobrenatural oculta. Albergando sentimientos por Kurou, Kotoko lo recluta para que la ayude a manejar a los youkai. Dos años después, un trágico accidente se cobra la vida de un ídolo, pero esta regresa como una mujer sin rostro que empuña vigas de acero. Kotoko y su compañero investigan la aparición, solo para descubrir un caso mucho más siniestro y personal de lo que inicialmente anticipaban.

Tras ayudar a resucitar a la formidable vampira Kiss-shot Acerola-orion Heart-under-blade, Koyomi Araragi se ha transformado en vampiro y ha asumido el papel de su sirviente. Aunque Kiss-shot está convencida de que puede restaurar su humanidad una vez que recupere toda su fuerza, Araragi debe ahora enfrentar las consecuencias de sus actos. Ha logrado rastrear a los tres cazadores de vampiros que previamente derrotaron a Kiss-shot y recuperar sus extremidades. Sin embargo, a medida que se acerca al cumplimiento de su objetivo, comienza a preguntarse si realmente desea revivir a un ser tan poderoso e inmortal, especialmente porque no habría manera de controlarla después. Araragi se enfrenta a misterios más profundos sobre el conflicto pasado: si él, un vampiro recién convertido, pudo vencer a los cazadores, ¿por qué ellos derrotaron a Kiss-shot inicialmente? También debe determinar si puede confiar en su promesa de restaurar su forma humana y entender cómo es siquiera posible tal hazaña. Llevado al límite, Araragi debe tomar una decisión crítica, que potencialmente requerirá una acción que lamentará profundamente para resolver la situación.

A pesar del regreso de la paz a Ikebukuro, los fenómenos extraños se han convertido en una parte habitual de la vida cotidiana. La policía continúa su persecución implacable de Celty Sturluson, la Jinete Sin Cabeza, mientras que una cuantiosa recompensa por su cabeza motiva a varias bandas a cazar a esta criatura sobrenatural. Mientras tanto, Mikado Ryuugamine se enfrenta a Aoba Kuronuma, un enigmático kohai con motivos ocultos, quien revela que está al tanto de la verdadera identidad de Mikado. Sin embargo, la calma de la ciudad es efímera, ya que surge una nueva amenaza en la forma de un asesino conocido como «Hollywood», que utiliza una máscara diferente en cada crimen. A medida que estos incidentes dispares vuelven a revelar sus conexiones subyacentes, Ikebukuro se sumerge en un nuevo conflicto, con el riesgo de que todo el metropolis caiga en el caos total.

Un nuevo estudiante de aspecto extraño, Ougi Oshino, llega a la preparatoria Naoetsu y es presentado a Koyomi Araragi por su amiga mutua Kanbaru Suruga, quien busca consejo sobre un descubrimiento peculiar. Al inspeccionar la escuela, Ougi divisa un salón de clases que ha aparecido en un espacio previamente vacío, un lugar que no debería existir. Sospechando que hay intervención sobrenatural, Araragi y Ougi investigan el misterio. Después de quedar atrapados dentro con Ougi, Araragi se da cuenta de que la sala contiene los recuerdos de un evento que había olvidado hace mucho tiempo.

Koyomi Araragi, ahora ya no completamente humano, se embarca en recuperar los miembros cercenados de Kiss-shot Acerola-orion Heart-under-blade, robados por tres poderosos cazadores de vampiros. En su camino se interponen Dramaturgie, un vampiro que caza a su propia especie; Episode, un medio vampiro capaz de convertirse en niebla; y Guillotinecutter, un sacerdote humano que es el más peligroso del trío. Sin que Araragi lo sepa, cada momento que pasa persiguiendo las partes del cuerpo de Kiss-shot lo aleja más de la humanidad y lo hunde más en el vampirismo. ¿Podrá aferrarse a la esperanza de volverse humano cuando sus batallas lleguen a su fin?

El infame Shounen Bat extiende el miedo por toda la ciudad de Musashino. Deslizándose sobre patines en línea y golpeando a la gente con un bate de béisbol dorado, el atacante permanece escurridizo y desconcertante. Su primera víctima, la famosa pero tímida diseñadora de personajes Tsukiko Sagi, es sospechosa de orquestar los asaltos. Solo su peluche rosado antropomórfico, Maromi, cree en su inocencia, mientras Tsukiko se convierte en uno de los muchos objetivos. A medida que Shounen Bat continúa implacablemente sus ataques, los detectives Keiichi Ikari y Mitsuhiro Maniwa inician una investigación sobre la identidad del agresor. Sin embargo, más personas caen presa del infame bate dorado, y la noticia del perpetrador se extiende por toda la ciudad. La paranoia se apodera mientras rumores escalofriantes circulan entre adultos y niños por igual. ¿Podrán los dos detectives descubrir la verdad detrás de Shounen Bat, o la paranoia los consumirá primero?

Tras la graduación de Koyomi Araragi y Hitagi Senjougahara, quienes han seguido adelante, en la Academia Privada Naoetsu apenas quedan estudiantes conocidos. Entre ellos se encuentra Suruga Kanbaru, quien aún porta el Monkey's Paw. Cuando se entera de rumores sobre una misteriosa figura llamada el "Diablo" que supuestamente resuelve cualquier problema mediante medios sobrenaturales, Kanbaru sospecha de inmediato que se refieren a ella y sale a investigar. Descubre que el Diablo es en realidad Rouka Numachi, una exrival de baloncesto de la secundaria que ya no puede jugar debido a una lesión en la pierna. Rouka ofrece consejos gratuitos a cualquiera que acuda a ella, actuando como una coleccionista de desgracias y disfrutando del alivio que sus clientes sienten ante la falsa esperanza de que sus problemas se resolverán. Aunque Kanbaru no ve un daño real en esto, igualmente reprende a Rouka por mentir y regresa a casa, aliviada de no ser ella la fuente de los rumores. Sin embargo, tal vez tenga motivos para preocuparse después de todo: descubre que su mano izquierda ha vuelto a su forma humana.

La Academia Privada Seikyou, una escuela impregnada del atractivo de las leyendas ocultistas tradicionales, oculta una historia sombría: durante seis décadas, ha sido acechada por un fantasma llamado Yuuko, una chica que murió de forma inexplicable en el sótano del antiguo edificio escolar. Incapaz de recordar su vida ni su muerte, Yuuko establece y dirige en secreto el Club de Investigaciones Paranormales en su búsqueda de respuestas. Cuando se encuentra con el brillante estudiante de primer año Teiichi Niiya, quien puede ver al peculiar espectro, Yuuko se aferra a él. Los dos se vinculan rápidamente y Teiichi resuelve ayudarla. Junto con Kirie Kanoe, familiar de Yuuko, y Momoe Okonogi, estudiante de segundo año que desconoce la verdad, se adentran en los notorios Siete Misterios que acechan el histórico campus.