Sinopsis
Narumi Katou, un hombre de mediana edad, padece el raro e inexplicable Síndrome ZONAPHA, que provoca ataques severos y aleatorios que solo pueden aliviarse al presenciar la risa de alguien. Mientras trabaja en un empleo a tiempo parcial, se encuentra con un niño pequeño que carga una maleta grande y huye de tres adultos. El niño, Masaru Saiga, revela que es el nuevo heredero del vasto imperio Saiga Enterprises tras la reciente muerte de su padre, y que otros miembros de la familia planean asesinarlo para apoderarse de la herencia. Decidido a proteger al niño, Narumi ayuda a Masaru a escapar y lucha contra sus perseguidores, solo para descubrir que son marionetas humanoides conscientes con fuerza sobrehumana. Cuando Narumi está a punto de ser derrotado, aparece una chica de cabello blanco y convoca a otra marioneta desde la maleta del niño, presentándose como Shirogane, la guardiana de Masaru. Karakuri Circus sigue a tres individuos de distintos ámbitos cuyos destinos se entrelazan y divergen mientras descubren los secretos de una antigua historia de amor y traición, y el prolongado conflicto entre humanos y marionetas.