Night Raid fungiert als die geheime Mördertruppe der Revolutionären Armee, einer Fraktion, die gegründet wurde, um Premierminister Honest zu stürzen. Honeasts unersättliche Gier nach Macht hat es ihm ermöglicht, den unerfahrenen Kindkaiser zu manipulieren, während die gesamte Nation unter Armut, Konflikten und Verfall leidet, bedingt durch das Fehlen starker und wohltätiger Führung. Obwohl die Mitglieder von Night Raid erfahrene Mörder sind, sind sie sich bewusst, dass das Töten von Menschenleben keine tugendhafte Tat ist, und erwarten Vergeltung, während sie rücksichtslos alle Hindernisse für die Revolution beseitigen.
Tatsumi, ein naiver junger Mann aus einem fernen Dorf, schließt sich dieser Gruppe von Attentätern an. Er hatte sich ursprünglich auf den Weg gemacht, um die Not seiner verarmten Heimatstadt zu lindern, wurde aber sowohl von den Idealen als auch von der Entschlossenheit von Night Raid überzeugt. Akame ga Kill! schildert Tatsumis Kampf gegen das Imperium, während er auf mächtige Waffen, rivalisierende Attentäter und Prüfungen seiner persönlichen Ethik stößt und schließlich die wahre Bedeutung eines von einem Ziel getriebenen Attentäters entdeckt.