Ein katastrophales Ereignis hat Japan in eine endlose Wüste verwandelt, und eine geheimnisvolle Rostplage verwüstet die Überreste der Zivilisation. Die Behörden machen die Verbreitung von Pilzsporen für diese düstere neue Realität verantwortlich und zeigen auf Bisco Akaboshi, den sie den »Menschenfresser-Pilz« nennen, als den Schuldigen.
Bisco jedoch sieht die Dinge anders. Er ist ein »Pilzschützer« auf einer Mission, den sagenumwobenen »Sabikui«-Pilz zu finden, der als das ultimative Heilmittel gegen die Rostkrankheit gilt. Auf dieser Reise begleiten ihn seine Riesenameise Akutagawa und Dr. Milo Nekoyanagi, ein freundlicher Arzt, der nach einem Heilmittel für die Rostvergiftung seiner Schwester sucht. Trotz der Vorurteile, denen er von der Öffentlichkeit ausgesetzt ist, bleibt Bisco entschlossen, die verfallende Welt zu reinigen.
