Haruka Nanase hegt eine tiefe Leidenschaft für das Wasser und einen unstillbaren Drang zu schwimmen. In der Grundschule schlossen er und seine drei Freunde, Rin Matsuoka, Nagisa Hazuki sowie Makoto Tachibana, ein Bündnis, um gemeinsam ein Staffelrennen zu gewinnen. Nach diesem Triumph trennten sich die vier jedoch. Jahre später kommen sie sich in der Oberschule wieder in den Weg, doch Rin hat kein Interesse daran, die alte Verbindung wieder aufleben zu lassen. Er besucht eine andere Schule und möchte lediglich beweisen, dass er ein besserer Schwimmer als Haruka ist. Nach einem angespannten Zusammentreffen gründen Haruka, Nagisa und Makoto den Schwimmclub der Iwatobi-Oberschule, benötigen jedoch ein viertes Mitglied, um am bevorstehenden Turnier teilnehmen zu dürfen. Nagisa wirbt Rei Ryuugazaki, einen ehemaligen Leichtathleten, für diesen Platz an. Während der Wettkampf näher rückt, wachsen die vier durch intensives Training zusammen, mit dem Ziel, die Veranstaltung zu gewinnen und die Rivalität zwischen Haruka und Rin endgültig beizulegen.