Tausend Jahre sind vergangen seit den "Sieben Tagen des Feuers", einem katastrophalen Atomkrieg, der fast alles Leben auf der Erde ausgelöscht hat. Die Menschheit kämpft nun ums Überleben gegen einen tückischen Dschungel, der sich als Reaktion auf die Zerstörung durch die Menschen entwickelt hat. Gefüllt mit giftigen Sporen und riesigen Insekten breitet sich dieser Dschungel schnell über die Welt aus und droht, den Rest der Menschheit zu verschlingen.
Fern von diesem Dschungel liegt das friedliche Ackerbaukönigreich, das als "Tal des Windes" bekannt ist, dessen Küstenlage es vor den tödlichen Toxinen des Dschungels schützt. Die charismatische junge Prinzessin des Tales, Nausicaä, sieht ihr ruhiges Königreich gestört, als ein Luftschiff aus Tolmekia heftig im Tal abstürzt. Nachdem Nausicaä und die Bürger des Tales ein unheimliches pulsierendes Objekt in den Trümmern entdecken, fällt das tolmekische Militär in das Tal ein, mit der Absicht, eine gefährliche Waffe aus den Sieben Tagen des Feuers wiederzubeleben. Nun muss Nausicaä kämpfen, um die Tolmekier davon abzuhalten, die Erde in eine Katastrophe zu stürzen, die die Menschheit niemals überleben könnte, und gleichzeitig das Tal vor den vorrückenden Kräften des giftigen Dschungels zu schützen.