Handlung
Auf der Marskolonie Fourth Tokyo arbeiten die hellsten Schüler der Kirishina Corporation in einem Klassenzimmer, das der Luft- und Raumfahrtentwicklung gewidmet ist: A-TEC. Unter der Leitung des brillanten Ingenieurs Kaito Sera wartet das Team gespannt auf die Ankunft ihres neuesten Mitglieds. Doch schnell wird klar, dass der Transferstudent alles andere als gewöhnlich ist. Nagisa Kiryuu, der neu ernannte Chef von A-TEC und jüngerer Bruder des CEO des Kirishina-Konzerns, wurde damit beauftragt, das Programm zu schließen. Um ihr Klassenzimmer am Leben zu erhalten, arbeiten Kaito und seine Schüler verzweifelt daran, einen Nachfolger für ihre leistungsstärkste Rakete, die X-2, zu entwickeln. In der Zwischenzeit steigt Nagisa die Karriereleiter hinauf, um seine eigene Mission zu verfolgen. Trotz ihrer getrennten Kämpfe wird bald klar, dass innerhalb der Kirishina Corporation viel mehr vor sich geht, als man auf den ersten Blick sieht. Classroom☆Crisis folgt Kaito und Nagisa, zusammen mit Kaitos jüngerer Schwester Mizuki und A-TECs Testpilotin Iris Shirasaki, in einer Geschichte voller Intrigen, politischer Machtkämpfe und, gegen alle Widrigkeiten, Romantik. Als Nagisa und A-TEC tiefer in die Verschwörungen der Kirishina Corporation hineingezogen werden, wachsen Freundschaften und vergangene Geheimnisse werden enthüllt, während sie darum kämpfen, ihre Klassenkrise abzuwenden.