Handlung
Diese Staffel knüpft direkt an Zero Duel Masters an und behält die alternative Umgebung, Handlung und Besetzung bei. Der einzige Unterschied zwischen den beiden Staffeln ist der Wechsel von 2D- zu 3DCGI-Animation. Sie setzt nach dem Duell zwischen Shobu und Hakuoh ein, später stellt sich heraus, dass Hakuoh und Jura mit Professor March zusammenarbeiten. Professor March verfolgt das Ziel, alle Kreaturen zu kontrollieren, indem alle Duel Orbs gesammelt werden.