Handlung
Die neuen Widersacher, Nahane und Ohanefu, starten zusammen mit geheimnisvollen kolossalen Wesen aus dem Weltall einen Feldzug zur Eroberung der Erde. Der Schlüssel zu diesen Ereignissen liegt im Shinkalion ALFA-X, einem geheimen Projekt des Ultra Evolution Institute. Für Hayato und das Team Shinkalion, die eine Zeit des Friedens genossen haben, entflammt der Konflikt erneut. Hayato kämpft mit Ängsten, nachdem sein Vater Hokuto während eines feindlichen Angriffs verschwindet. Plötzlich erscheint ein neunjähriger Hokuto aus der Zeit und dem Raum. Dieser junge Hokuto, der zusammen mit den Glowing Particles durch die Zeit rutschte, beschließt, den Shinkalion ALFA-X zu steuern – eine hochmoderne Maschine, die gebaut wurde, um die Erde zu verteidigen und die Normalität wiederherzustellen. Vereint durch ihr gemeinsames Ziel stellt sich das Team Shinkalion – zusammengestellt aus Zweigen in Hokkaido, Yamagata, Ōmiya, Nagoya, Kyoto und Moji – dem mächtigsten Feind im Universum. Kann Team Shinkalion Japans Frieden und Sicherheit bewahren? Wird Hayato mit Hokuto wiedervereint?