Handlung
Yuusei Fudou ist entschlossen, das zurückzuerobern, was ihm genommen wurde. Das Duellieren hat eine neue Stufe erreicht, und Riding Duels sind nun die oberste Unterhaltungsform für die Bewohner von Neo Domino City. Diese Kämpfe werden auf D-Wheels ausgetragen, Maschinen, die Duel Disks mit Motorrädern kombinieren. Nachdem Yuusei, ein erfahrener Mechaniker, sein eigenes D-Wheel gebaut hatte, stahl sein ehemaliger Freund Jack Atlas es zusammen mit Yuuseis wertvollster Karte, Stardust Dragon. Jack verließ daraufhin ihre heruntergekommene Heimatstadt Satellite und floh nach Neo Domino City. In den zwei Jahren seitdem ist Jack an die Spitze der Duellwelt aufgestiegen, während Yuusei sich mit Hilfe seiner Freunde vorbereitet hat. Nun, da sein neues D-Wheel fertig ist, macht er sich mit dem alleinigen Ziel auf den Weg nach Neo Domino City, Jack zu finden. Keiner von ihnen ahnt, dass weitaus größere Kräfte im Spiel sind, mit versteckten Drahtziehern, die die Ereignisse aus den Schatten steuern.