Ken Kaneki finalmente ha abrazado su naturaleza monstruosa y su insaciable hambre de carne, algo que antes temía y despreciaba. Tras escapar del cautiverio y la tortura, se une a Aogiri Tree, el grupo militar de ghouls que fue responsable de su secuestro, lo que provoca que sus amigos cuestionen sus verdaderas intenciones y lealtad. A medida que crecen las hostilidades entre las autoridades y los ghouls, la Commission of Counter Ghoul, la agencia estatal especializada en contra de los ghouls, intensifica su campaña para erradicarlos en todo Tokio. Esto pone en peligro la frágil paz que los amigos y antiguos compañeros de Kaneki, los ghouls de la cafetería Anteiku, habían logrado mantener. Consciente del riesgo, Kaneki se ve involucrado en múltiples conflictos que amenazan su humanidad, ya frágil y en declive.