Los Pokémon son seres extraordinarios con una diversidad de habilidades y formas; muchas personas, denominadas entrenadores Pokémon, los capturan y adiestran, frecuentemente para enfrentarlos en combates. El joven Satoshi no solo anhela ser un entrenador Pokémon, sino también un "Maestro Pokémon", y en su décimo cumpleaños, finalmente obtiene la oportunidad de hacer realidad tal sueño. Desafortunadamente para él, los tres Pokémon disponibles para nuevos entrenadores ya han sido reclamados, quedando únicamente Pikachu, un Pokémon de tipo Eléctrico rebelde. No obstante, este encuentro fortuito marcaría el inicio de una amistad eterna y una aventura épica.
Aventurándose para convertirse en el mejor, Satoshi y Pikachu viajan por regiones hermosas y vastas junto a sus amigos Kasumi, una entrenadora de tipo Agua, y Takeshi, un entrenador de tipo Roca. Sin embargo, el peligro acecha en cada esquina. El infame Team Rocket siempre está cerca, intentando robar Pokémon poderosos mediante planes retorcidos. Dependerá de Satoshi y sus amigos detener sus esfuerzos, mientras él también se esfuerza por ganar las ocho Medallas de Gimnasio Pokémon necesarias para desafiar a la Liga Pokémon y eventualmente reclamar el título de Maestro Pokémon.