¡Encontrar un tesoro siempre es difícil! Pero nada es imposible para Doraemon y sus herramientas mágicas. Así que, con la ayuda de Doraemon, Nobita y el resto del grupo zarpan en un barco para buscar un tesoro en una isla. Sin embargo, en el camino, el barco casi es destruido, lo que hace que Nobita quede varado en una isla junto a un joven pirata, mientras Doraemon y los demás se ven envueltos en una guerra entre piratas. Y así comienza su aventura...