Handlung
Mit einer Erzählung, die unabhängig von der Kontinuität des ursprünglichen Appleseed-Films ist, obwohl derselbe Regisseur verantwortlich zeichnet, bietet Appleseed Alpha einen alternativen Ursprung für seine Protagonisten. Anders als in früheren Versionen ist Briareos bereits ein Cyborg und teilt keine vorherige Trennung oder Wiedervereinigung mit Deunan, bevor er ESWAT in Olympus beitritt. Die Geschichte konzentriert sich auf die frühen Tage von Deunan Knute und Briareos im 22. Jahrhundert, während sie die dystopischen Ruinen New Yorks durchqueren und nach der utopischen Stadt Olympus suchen. Angeheuert von Two Horns, dem Kriegsherrn, der die verwüstete Stadt regiert, wird das Duo damit beauftragt, zweibeinige Kampfmaschinen zu zerstören. Während dieses Auftrags kreuzen sie den Weg von Iris und Olson, die sich auf einer eigenen Mission befinden. Nachdem sie sich mit ihnen angefreundet haben, beschließen Deunan und Briareos, sich mit den beiden zu verbünden. Iris’ Ziel ist es, den finsteren Cyborg Talos daran zu hindern, eine geheime menschliche Waffe an sich zu reißen. Allerdings manipuliert Talos Iris dazu, die gewaltige Kriegsmaschine zu aktivieren.